カスタムshSET・shCombo
カスタムshSET
サービス概要
ｓｈRNA配列解析をし、その結果から（1, 3, 5）本の組込みDNAを合成するサービスです。
合成するDNAはクラスX、5nmol保証、約70mer x 2本です。
合成DNAの5’リン酸化、カスタム構築サービスなどのオプションも承っております。
ご利用のベクターに合わせてカスタマイズいたします。
共通配列からの選択・回避（オプションA、B）も別途追加可能です。
また、弊社取扱いのSBI社製ベクターも併せてご利用下さい。
こちらをご利用の場合は、カスタムshSETの定価より10,000円値引いたします。
＜サービス概要＞
カスタムshSET
（解析＋組込みDNA合成）
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カスタムshSET -1 (DNA, 5nmol)
カスタムshSET -3 (DNA, 5nmol)
カスタムshSET -5 (DNA, 5nmol)
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DNA 5’リン酸化オプション（1nmol保証）
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siRNA発現用
DNA組込みサービス
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shRNA配列の発現ベクターへの組込み、配列確認
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| ウイルス粒子調製 |
小スケールパッケージング
大スケールパッケージング
高濃度調製（上記10倍濃縮）
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製品仕様
カスタムshSET
ターゲット配列
デザイン
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指定のターゲットmRNA配列を元に、shRNA配列を設計。
独自のアルゴリズムB-Algoがノックダウン効率を最大に、
かつ配列特異的なオフターゲットを最小限に抑えるデザインを行います。
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| 種 |
特に制限無し。
但し、比較するデータベースはHuman/Mouse/Rat のみ
オーダー時に指定が無い場合は、Humanのデータベースを使用
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| ターゲット遺伝子情報 |
ユーザー指定 (アクセッション番号 または オリジナル配列も可)
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| ベクター別最適化 |
ベクターにあわせて配列をカスタマイズします。ご利用のベクターの商品名、
販売元（市販の場合）、カタログ番号、プロモーターの種類、前後配列（制限
酵素の切断サイトを含む）、ループ配列をお知らせください。
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| 解析範囲の指定 |
(1) CDS領域+3'UTR
(2) CDS領域のみ
(3) 3’UTR領域のみ
オーダー時に指定が無い場合は、CDS領域+3'UTRを解析
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| バリアント |
バリアントを同時にノックダウンするか否かは考慮しません。
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| 合成配列 |
コスモ・バイオお任せ
コスモ・バイオにて選択し、そのまま合成手配へと進めます。
※合成配列を選択されたい場合は、オプションの解析レポートをご利用ください。
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解析レポート
(オプション) |
ターゲット配列デザイン → 最終候補5候補から選択
配列デザイン結果をレポートにてご提供。
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shCombo(shRNAコンボセット）
サービス概要
・ shRNA配列解析＋siRNA合成
・ B-Algo で実績平均80％以上のノックダウン効率
・ SNPs、ホモロジーを考慮
・ 独自に開発したユニークなシステム
・ siPRECISE はどこにミスマッチがあっても検出可能
・ オフターゲット検索も追加可能（解析オプション）
・ RNAi効果確認用 プライマーデザイン＋合成サービス
製品仕様
| サービス内容 |
shRNA解析＋siRNA合成1本
shCombo1 (siRNAクラスX, 25nmol x 1本)
shRNA解析＋siRNA合成3本
shCombo3 (siRNAクラスX, 25nmol x 3本)
shRNA解析＋siRNA合成5本
shCombo5 (siRNAクラスX, 25nmol x 5本)
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ターゲット配列
デザイン
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指定のターゲットmRNA配列を元に、siRNA配列を設計
独自のアルゴリズムB-Algoがノックダウン効率を最大に、かつ配列特異的なオフターゲットを最小限に抑えるデザインを行います。
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| 種 |
特に制限無し。
但し、比較するデータベースはHuman/Mouse/Ratのみ
オーダー時に指定が無い場合は、Humanのデータベースを使用
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| 解析用遺伝子配列 |
ユーザー指定 (アクセッション番号 または オリジナル配列も可)
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| 解析範囲の指定 |
(1) CDS領域+3'UTR
(2) CDS領域のみ
(3) 3’UTR領域のみ
オーダー時に指定が無い場合は、CDS領域+3'UTRを解析
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| バリアント |
指定ターゲット配列を必ずターゲットとしますがその他は考慮しません。
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| 解析レポート |
あり
※合成配列を選択ください。
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| ベクター別最適化 |
ベクターにあわせて配列をカスタマイズします。ご利用のベクターの商品名、販売元（市販の場合）、カタログ番号、プロモーターの種類、前後配列（制限酵素の切断サイトを含む）、ループ配列をお知らせください。
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siRNA発現用DNA組込みサービス
ご指定頂いたshRNA配列をSBI社の発現ベクター※※に組込みます。シークエンシングにより挿入配列を含む周辺配列を確認します。
※※SBI社以外のベクターも考慮致します。詳細はお問合せください。
※ SBI社のベクター購入料金は、別途頂戴いたします。
※ ご購入いただきました空ベクター・構築済みベクターの残余品はお届けいたします。
＜関連製品＞
発現ベクターリスト（SBI社）
| ベクター名 |
カタログ番号 |
ベクター骨格 |
| pSIF1-H1-Puro |
SI100C-1 |
FIV |
| pSIF1-H1-copGFP |
SI101B-1 |
FIV |
| pSIH1-H1-Puro |
SI500A-1 |
HIV |
| pSIH1-H1-copGFP |
SI501A-1 |
HIV |
価格
| 製品名 |
カタログ番号 |
価格（税抜） |
| カスタムshSET-1 |
SVD19-105 |
¥62,000 |
| カスタムshSET-3 |
SVD19-305 |
¥93,000 |
| カスタムshSET-5 |
SVD19-505 |
¥122,000 |
| shCombo1 |
SVAV21-125 |
¥69,000 |
| shCombo3 |
SVAV21-325 |
¥108,000 |
| shCombo5 |
SVAV21-525 |
¥150,000 |
ご注文方法
ご注文は、コスモ・バイオ カスタムshSET, shCombo注文書 をご利用ください。
注文書に必要事項をご記入のうえ、E-mail： まで添付ファイルとしてお送り下さい。
