北海道システム・サイエンス
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製品・サービス情報
SNP解析
概要 サービス内容 納期・価格 注文方法 注意事項

■製品の特徴
概要
本サービスではPCR産物のダイレクトシーケンスにより塩基配列を決定し、あらかじめご提供いただいたリファレンス配列との配列比較を行いSNP部位を決定いたします。
その後、得られた波形チャートと併せて、結果をご報告いたします。

サービス内容
●ご提供いただくもの

精製済みPCR産物10ng/μL以上に調整いただき、1解析あたり20μL以上をご用意ください。
シーケンスプライマー(Forward,Reverse)
電気泳動写真
シーケンスの対象となる遺伝子情報(リファレンス配列、既知の変異情報等)

解析に必要となる前処理(PCR産物の精製、遺伝子増幅、プライマー設計・合成等)をご希望される場合は、各種オプション(別途料金)にてお引き受けしております。
詳細につきましては、ご相談ください。



●基本内容

  ・シーケンス反応
  Forward,Reverse Primerを使用したDouble Strand解析
  ↓
  ・データ解析
  リファレンス配列との比較によるSNP部位の決定
  ↓
  ・結果のご報告
  解析結果は ウェブサイト経由および CD-R にて納品いたします。
  塩基配列データ(txt形式) / 波形データ(Ab1形式)
  作業報告書 / SNP部位のレポート

  ※ ウェブサイトにアップロードしたデータは3か月ほどで消去されますのでご注意ください。




●データ解析

送付いただいたPCR産物を用いて両鎖によるシーケンス解析を実施。
リファレンスの配列との比較を行いSNP部位を決定いたします。



納期・価格
※単位:円 (税別)
価格 14,000 / 1検体
納期 2週間〜

1検体から承ります。
納期は検体数、作業内容によって変動します。
プライマーの設計・合成、目的領域の増幅等、ご要望に応じて各工程からもお引き受けが可能です。


注文方法
【1】 HPより注文書をダウンロードしてください。

【2】 注文書に必要事項をご記入の上、添付ファイルとしてE-mail を まで送信してください。

【3】 メールにて送信後、サンプル、プライマー、電気泳動写真、注文書原本を併せて下記宛にお送りください。
ご送付の際は「シーケンスサンプル在中」と明記いただけますよう、お願いいたします。

<サンプル送付先>
〒001-0932 
札幌市北区新川西2条1丁目2-1
北海道システム・サイエンス株式会社
ライフサイエンス本部 解析部 シーケンスチーム

土・日・祝日はサンプルの受け取りを行っておりませんので、平日着となるよう送付してください。


注意事項
病原性を有する、または有する可能性のある微生物、および分離源が臨床試料や動物由来の
微生物等についてはお引き受けしておりません。
解析試料はDNAの状態になったものに限ります。血液などの生体試料はお受けいたしておりません。
ご依頼いただくサンプルは、文部科学省が「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律」(カルタヘナ法)におけるP1レベルのサンプルに限らせていただきます。
シーケンスプライマーの直下はデータの信頼性が低下いたしますので、あらかじめご考慮いただきますようお願いいたします。
データの信頼性を得るため、シーケンス解析はForward,Reverse Primerを使用したDouble Strand 解析を行います。PCR産物のサイズは300bp-500bp程度を推奨しております。
リファレンス配列、既知のSNP情報は、必ず、電子ファイルにてご提供ください。
送付していただいたサンプルは、品質検査を実施いたします。
品質検査により解析が困難と思われる場合は、解析をお受けできない場合もございますので、あらかじめご了承ください。



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